Protein–RNA interactions for Protein: P36075

CUE2, Ubiquitin-binding protein CUE2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE2P36075 KCS1YDR017C 3153 nt1.57□□□□□ -2.16
CUE2P36075 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt1.57□□□□□ -2.16
CUE2P36075 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt1.57□□□□□ -2.16
CUE2P36075 KIP1YBL063W 3336 nt1.56□□□□□ -2.16
CUE2P36075 YML002WYML002W 2214 nt1.56□□□□□ -2.16
CUE2P36075 IRA1YBR140C 9279 nt1.56□□□□□ -2.16
CUE2P36075 YLR041WYLR041W 321 nt1.56□□□□□ -2.16
CUE2P36075 FYV10YIL097W 1551 nt1.55□□□□□ -2.16
CUE2P36075 SFB2YNL049C 2631 nt1.54□□□□□ -2.16
CUE2P36075 MSH6YDR097C 3729 nt1.54□□□□□ -2.16
CUE2P36075 MEC1YBR136W 7107 nt1.54□□□□□ -2.16
CUE2P36075 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt1.54□□□□□ -2.16
CUE2P36075 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt1.54□□□□□ -2.16
CUE2P36075 snR14snR14 160 nt1.54□□□□□ -2.16
CUE2P36075 GLG1YKR058W 1851 nt1.54□□□□□ -2.16
CUE2P36075 ORC3YLL004W 1851 nt1.53□□□□□ -2.16
CUE2P36075 NUT1YGL151W 3399 nt1.53□□□□□ -2.17
CUE2P36075 ALY2YJL084C 3141 nt1.52□□□□□ -2.17
CUE2P36075 SXM1YDR395W 2835 nt1.52□□□□□ -2.17
CUE2P36075 RAD50YNL250W 3939 nt1.52□□□□□ -2.17
CUE2P36075 snR53snR53 91 nt1.52□□□□□ -2.17
CUE2P36075 YAR009CYAR009C 3591 nt1.52□□□□□ -2.17
CUE2P36075 CCH1YGR217W 6120 nt1.51□□□□□ -2.17
CUE2P36075 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.5□□□□□ -2.17
CUE2P36075 NUP192YJL039C 5052 nt1.5□□□□□ -2.17
CUE2P36075 TRM3YDL112W 4311 nt1.49□□□□□ -2.17
CUE2P36075 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt1.49□□□□□ -2.17
CUE2P36075 snR47snR47 99 nt1.49□□□□□ -2.17
CUE2P36075 PAN2YGL094C 3348 nt1.48□□□□□ -2.17
CUE2P36075 RPL26BYGR034W 384 nt1.48□□□□□ -2.17
CUE2P36075 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.48□□□□□ -2.17
CUE2P36075 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt1.48□□□□□ -2.17
CUE2P36075 SKI3YPR189W 4299 nt1.48□□□□□ -2.17
CUE2P36075 PIK1YNL267W 3201 nt1.48□□□□□ -2.17
CUE2P36075 MYO1YHR023W 5787 nt1.48□□□□□ -2.17
CUE2P36075 AZF1YOR113W 2745 nt1.47□□□□□ -2.17
CUE2P36075 SSK2YNR031C 4740 nt1.47□□□□□ -2.17
CUE2P36075 ASE1YOR058C 2658 nt1.47□□□□□ -2.17
CUE2P36075 MON2YNL297C 4911 nt1.47□□□□□ -2.17
CUE2P36075 snR190snR190 190 nt1.47□□□□□ -2.17
CUE2P36075 SMC1YFL008W 3678 nt1.47□□□□□ -2.17
CUE2P36075 SMC4YLR086W 4257 nt1.47□□□□□ -2.17
CUE2P36075 PET127YOR017W 2403 nt1.47□□□□□ -2.17
CUE2P36075 MMS4YBR098W 2076 nt1.46□□□□□ -2.18
CUE2P36075 HKR1YDR420W 5409 nt1.45□□□□□ -2.18
CUE2P36075 NOP9YJL010C 2001 nt1.45□□□□□ -2.18
CUE2P36075 GEA2YEL022W 4380 nt1.45□□□□□ -2.18
CUE2P36075 FYV8YGR196C 2454 nt1.45□□□□□ -2.18
CUE2P36075 YDL073WYDL073W 2955 nt1.44□□□□□ -2.18
CUE2P36075 BST1YFL025C 3090 nt1.44□□□□□ -2.18
CUE2P36075 snR64snR64 101 nt1.44□□□□□ -2.18
CUE2P36075 WAR1YML076C 2835 nt1.44□□□□□ -2.18
CUE2P36075 EMC5YIL027C 426 nt1.43□□□□□ -2.18
CUE2P36075 SEC10YLR166C 2616 nt1.42□□□□□ -2.18
CUE2P36075 ANS1YHR126C 480 nt1.42□□□□□ -2.18
CUE2P36075 NNF2YGR089W 2811 nt1.42□□□□□ -2.18
CUE2P36075 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.42□□□□□ -2.18
CUE2P36075 STO1YMR125W 2586 nt1.42□□□□□ -2.18
CUE2P36075 KAP122YGL016W 3246 nt1.42□□□□□ -2.18
CUE2P36075 CAT8YMR280C 4302 nt1.41□□□□□ -2.18
CUE2P36075 BRR2YER172C 6492 nt1.41□□□□□ -2.18
CUE2P36075 UBP3YER151C 2739 nt1.4□□□□□ -2.18
CUE2P36075 RAD9YDR217C 3930 nt1.4□□□□□ -2.18
CUE2P36075 TRM732YMR259C 4263 nt1.38□□□□□ -2.19
CUE2P36075 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.38□□□□□ -2.19
CUE2P36075 MSN5YDR335W 3675 nt1.38□□□□□ -2.19
CUE2P36075 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.35□□□□□ -2.19
CUE2P36075 snR50snR50 90 nt1.35□□□□□ -2.19
CUE2P36075 RPM2YML091C 3609 nt1.34□□□□□ -2.19
CUE2P36075 EST2YLR318W 2655 nt1.33□□□□□ -2.2
CUE2P36075 MSH3YCR092C 3057 nt1.32□□□□□ -2.2
CUE2P36075 CDC25YLR310C 4770 nt1.31□□□□□ -2.2
CUE2P36075 YKL225WYKL225W 348 nt1.31□□□□□ -2.2
CUE2P36075 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.3□□□□□ -2.2
CUE2P36075 NST1YNL091W 3723 nt1.3□□□□□ -2.2
CUE2P36075 BEM3YPL115C 3387 nt1.29□□□□□ -2.2
CUE2P36075 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.29□□□□□ -2.2
CUE2P36075 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt1.29□□□□□ -2.2
CUE2P36075 APL3YBL037W 3078 nt1.29□□□□□ -2.2
CUE2P36075 EST1YLR233C 2100 nt1.28□□□□□ -2.2
CUE2P36075 CLU1YMR012W 3834 nt1.27□□□□□ -2.21
CUE2P36075 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.27□□□□□ -2.21
CUE2P36075 PRP16YKR086W 3216 nt1.27□□□□□ -2.21
CUE2P36075 NUP188YML103C 4968 nt1.27□□□□□ -2.21
CUE2P36075 BUD3YCL014W 4911 nt1.27□□□□□ -2.21
CUE2P36075 SEC3YER008C 4011 nt1.26□□□□□ -2.21
CUE2P36075 NUP145YGL092W 3954 nt1.26□□□□□ -2.21
CUE2P36075 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt1.25□□□□□ -2.21
CUE2P36075 SEC8YPR055W 3198 nt1.23□□□□□ -2.21
CUE2P36075 CDC39YCR093W 6327 nt1.23□□□□□ -2.21
CUE2P36075 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt1.23□□□□□ -2.21
CUE2P36075 LAA1YJL207C 6045 nt1.23□□□□□ -2.21
CUE2P36075 SWI4YER111C 3282 nt1.22□□□□□ -2.21
CUE2P36075 snR69snR69 101 nt1.22□□□□□ -2.21
CUE2P36075 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.22□□□□□ -2.21
CUE2P36075 snR38snR38 95 nt1.22□□□□□ -2.21
CUE2P36075 ROM2YLR371W 4071 nt1.21□□□□□ -2.22
CUE2P36075 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.21□□□□□ -2.22
CUE2P36075 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.21□□□□□ -2.22
CUE2P36075 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.21□□□□□ -2.22
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