Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE6BP35913 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6BP35913 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms