Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RCVRNP35243 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RCVRNP35243 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms