Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
HOXC13P31276 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXC13P31276 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms