Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXA10P31260 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA10P31260 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms