Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM4SF1P30408 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM4SF1P30408 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms