Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL4A5P29400 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A5P29400 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms