Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD34P28906 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CD34P28906 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CD34P28906 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD34P28906 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms