Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE4AP27815 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE4AP27815 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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