Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CD247P20963 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD247P20963 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD247P20963 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD247P20963 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD247P20963 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD247P20963 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD247P20963 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD247P20963 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD247P20963 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD247P20963 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD247P20963 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD247P20963 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD247P20963 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD247P20963 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD247P20963 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD247P20963 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD247P20963 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD247P20963 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms