Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NTF3P20783 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NTF3P20783 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTF3P20783 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTF3P20783 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTF3P20783 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms