Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD58P19256 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD58P19256 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD58P19256 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD58P19256 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms