Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXB4P17483 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXB4P17483 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms