Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ITGB4P16144 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB4P16144 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms