Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD44P16070 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD44P16070 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD44P16070 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD44P16070 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD44P16070 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD44P16070 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD44P16070 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD44P16070 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms