Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM27P14373 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms