Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GP1BBP13224 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GP1BBP13224 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms