Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD8BP10966 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CD8BP10966 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD8BP10966 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD8BP10966 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD8BP10966 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD8BP10966 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD8BP10966 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD8BP10966 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD8BP10966 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD8BP10966 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms