Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM228BP0C875 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM228BP0C875 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM228BP0C875 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM228BP0C875 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM228BP0C875 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM228BP0C875 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM228BP0C875 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM228BP0C875 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM228BP0C875 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM228BP0C875 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM228BP0C875 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM228BP0C875 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM228BP0C875 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM228BP0C875 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM228BP0C875 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM228BP0C875 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM228BP0C875 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms