Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CSF1RP07333 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF1RP07333 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms