Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYMSP04818 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYMSP04818 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYMSP04818 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYMSP04818 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYMSP04818 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYMSP04818 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYMSP04818 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TYMSP04818 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TYMSP04818 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TYMSP04818 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms