Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYCNP04198 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYCNP04198 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCNP04198 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCNP04198 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCNP04198 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCNP04198 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCNP04198 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCNP04198 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCNP04198 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCNP04198 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCNP04198 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCNP04198 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCNP04198 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCNP04198 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYCNP04198 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCNP04198 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCNP04198 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCNP04198 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCNP04198 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCNP04198 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCNP04198 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCNP04198 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCNP04198 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCNP04198 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCNP04198 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCNP04198 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCNP04198 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCNP04198 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYCNP04198 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYCNP04198 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYCNP04198 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms