Protein–RNA interactions for Protein: P02774

GC, Vitamin D-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCP02774 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCP02774 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCP02774 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCP02774 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCP02774 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCP02774 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCP02774 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCP02774 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCP02774 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCP02774 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCP02774 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCP02774 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCP02774 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCP02774 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GCP02774 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCP02774 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCP02774 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCP02774 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCP02774 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCP02774 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCP02774 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GCP02774 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCP02774 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCP02774 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCP02774 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCP02774 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCP02774 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCP02774 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCP02774 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCP02774 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCP02774 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCP02774 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCP02774 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GCP02774 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GCP02774 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCP02774 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCP02774 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCP02774 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCP02774 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCP02774 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GCP02774 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GCP02774 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GCP02774 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCP02774 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCP02774 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GCP02774 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCP02774 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GCP02774 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GCP02774 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCP02774 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCP02774 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GCP02774 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCP02774 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCP02774 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCP02774 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCP02774 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCP02774 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCP02774 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCP02774 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCP02774 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCP02774 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCP02774 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCP02774 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms