Protein–RNA interactions for Protein: P01571

IFNA17, Interferon alpha-17, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA17P01571 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFNA17P01571 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms