Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFNA21P01568 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFNA21P01568 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms