Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13A1P00488 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13A1P00488 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13A1P00488 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13A1P00488 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13A1P00488 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F13A1P00488 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
F13A1P00488 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
F13A1P00488 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
F13A1P00488 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
F13A1P00488 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
F13A1P00488 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
F13A1P00488 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
F13A1P00488 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F13A1P00488 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
F13A1P00488 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
F13A1P00488 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
F13A1P00488 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F13A1P00488 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F13A1P00488 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F13A1P00488 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F13A1P00488 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F13A1P00488 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
F13A1P00488 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
F13A1P00488 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
F13A1P00488 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms