Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOMM40O96008 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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