Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL3O95236 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
APOL3O95236 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOL3O95236 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOL3O95236 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOL3O95236 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOL3O95236 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOL3O95236 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOL3O95236 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOL3O95236 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOL3O95236 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOL3O95236 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOL3O95236 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOL3O95236 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms