Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UFL1O94874 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UFL1O94874 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
UFL1O94874 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UFL1O94874 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UFL1O94874 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UFL1O94874 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UFL1O94874 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UFL1O94874 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UFL1O94874 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UFL1O94874 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UFL1O94874 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UFL1O94874 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UFL1O94874 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UFL1O94874 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UFL1O94874 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UFL1O94874 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UFL1O94874 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UFL1O94874 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UFL1O94874 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UFL1O94874 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UFL1O94874 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UFL1O94874 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UFL1O94874 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UFL1O94874 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UFL1O94874 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UFL1O94874 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UFL1O94874 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms