Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOX1O75936 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BBOX1O75936 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms