Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP9O75884 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms