Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCATO75600 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCATO75600 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCATO75600 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCATO75600 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GCATO75600 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GCATO75600 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCATO75600 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCATO75600 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCATO75600 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCATO75600 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCATO75600 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GCATO75600 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCATO75600 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCATO75600 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCATO75600 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCATO75600 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCATO75600 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCATO75600 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCATO75600 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCATO75600 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCATO75600 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCATO75600 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCATO75600 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCATO75600 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCATO75600 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCATO75600 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCATO75600 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCATO75600 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCATO75600 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCATO75600 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCATO75600 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCATO75600 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCATO75600 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GCATO75600 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCATO75600 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCATO75600 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCATO75600 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCATO75600 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCATO75600 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms