Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GADD45BO75293 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GADD45BO75293 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms