Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUBNO60494 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CUBNO60494 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUBNO60494 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUBNO60494 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUBNO60494 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUBNO60494 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUBNO60494 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUBNO60494 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUBNO60494 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUBNO60494 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUBNO60494 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUBNO60494 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUBNO60494 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUBNO60494 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUBNO60494 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUBNO60494 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUBNO60494 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUBNO60494 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUBNO60494 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUBNO60494 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUBNO60494 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUBNO60494 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUBNO60494 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms