Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRNO43815 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRNO43815 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STRNO43815 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STRNO43815 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRNO43815 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRNO43815 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRNO43815 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRNO43815 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRNO43815 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRNO43815 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRNO43815 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRNO43815 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRNO43815 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRNO43815 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRNO43815 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRNO43815 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRNO43815 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STRNO43815 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STRNO43815 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRNO43815 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRNO43815 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRNO43815 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRNO43815 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRNO43815 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRNO43815 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STRNO43815 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRNO43815 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRNO43815 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRNO43815 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STRNO43815 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STRNO43815 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRNO43815 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRNO43815 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRNO43815 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRNO43815 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRNO43815 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRNO43815 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRNO43815 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRNO43815 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STRNO43815 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STRNO43815 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
STRNO43815 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STRNO43815 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms