Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GATCO43716 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATCO43716 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATCO43716 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATCO43716 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATCO43716 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GATCO43716 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GATCO43716 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GATCO43716 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GATCO43716 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GATCO43716 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms