Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTIFO43310 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTIFO43310 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTIFO43310 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTIFO43310 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTIFO43310 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTIFO43310 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTIFO43310 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTIFO43310 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTIFO43310 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTIFO43310 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTIFO43310 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTIFO43310 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTIFO43310 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTIFO43310 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTIFO43310 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTIFO43310 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CTIFO43310 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTIFO43310 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTIFO43310 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTIFO43310 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTIFO43310 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTIFO43310 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTIFO43310 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTIFO43310 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTIFO43310 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTIFO43310 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTIFO43310 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTIFO43310 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTIFO43310 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTIFO43310 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTIFO43310 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTIFO43310 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTIFO43310 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTIFO43310 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTIFO43310 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTIFO43310 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTIFO43310 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTIFO43310 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTIFO43310 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTIFO43310 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTIFO43310 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTIFO43310 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTIFO43310 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTIFO43310 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTIFO43310 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTIFO43310 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTIFO43310 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTIFO43310 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTIFO43310 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTIFO43310 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTIFO43310 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTIFO43310 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTIFO43310 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTIFO43310 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTIFO43310 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTIFO43310 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTIFO43310 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTIFO43310 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTIFO43310 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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