Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRODHO43272 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRODHO43272 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRODHO43272 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PRODHO43272 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRODHO43272 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRODHO43272 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRODHO43272 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRODHO43272 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRODHO43272 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRODHO43272 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRODHO43272 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms