Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP290O15078 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP290O15078 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP290O15078 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP290O15078 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP290O15078 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP290O15078 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP290O15078 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP290O15078 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP290O15078 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CEP290O15078 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CEP290O15078 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CEP290O15078 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CEP290O15078 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CEP290O15078 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CEP290O15078 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CEP290O15078 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CEP290O15078 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CEP290O15078 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP290O15078 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP290O15078 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP290O15078 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP290O15078 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP290O15078 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP290O15078 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP290O15078 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP290O15078 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP290O15078 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP290O15078 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP290O15078 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP290O15078 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP290O15078 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP290O15078 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP290O15078 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP290O15078 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP290O15078 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP290O15078 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP290O15078 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP290O15078 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP290O15078 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP290O15078 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP290O15078 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP290O15078 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP290O15078 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP290O15078 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP290O15078 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP290O15078 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP290O15078 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP290O15078 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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