Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
O00370 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.3■■□□□ 1
O00370 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.3■■□□□ 1
O00370 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
O00370 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.29■■□□□ 1
O00370 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
O00370 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.28■■□□□ 1
O00370 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
O00370 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
O00370 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
O00370 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
O00370 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
O00370 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
O00370 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.27■■□□□ 1
O00370 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
O00370 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
O00370 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
O00370 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
O00370 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
O00370 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
O00370 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
O00370 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
O00370 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
O00370 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
O00370 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
O00370 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
O00370 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
O00370 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
O00370 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
O00370 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
O00370 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
O00370 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
O00370 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
O00370 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms