Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3QRK9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3QRK9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QRK9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QRK9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QRK9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QRK9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QRK9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QRK9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QRK9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QRK9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QRK9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QRK9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QRK9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QRK9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QRK9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QRK9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
J3QRK9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3QRK9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3QRK9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms