Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
J3KR12 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
J3KR12 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3KR12 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3KR12 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3KR12 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3KR12 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3KR12 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3KR12 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3KR12 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3KR12 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms