Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms