Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BL2E5RIL1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms