Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PATL2C9JE40 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PATL2C9JE40 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms