Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HMGB1P1B2RPK0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.8 ms