Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTLL13PA6NNM8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTLL13PA6NNM8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms