Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA6L4A6NEF3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms