Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL33A6NCF5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms