Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POTEFA5A3E0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms